In Overijssel wordt op ongeveer 30 locaties water gewonnen voor drinkwatervoorziening. Daarnaast zijn er nog vele winningen voor koel- en proceswater voor industrie. En nog eens vele kleine onttrekkingen voor de beregening van landbouwgewassen. Natuur en Milieu Overijssel is betrokken bij nieuw beleid voor beregenen tijdens droogte dat wordt ontwikkeld door Waterschap Regge en Dinkel.
Natuur en Milieu Overijssel beoordeeld vergunningen en probeert invloed uit te oefenen op de ligging en omvang van winningen. Om te zorgen dat er zo min mogelijk schade wordt veroorzaakt. In veel situaties liggen waterwinningen in of in directe omgeving van natuurgebieden. Het water in die gebieden is aantrekkelijk omdat het vaak erg schoon is maar het nadeel is de verdroging die dit veroorzaakt.